В 1946 года в Группу Советских Войск в Германии приехал основной состав команды ЦДКА и провёл несколько товарищеских матчей.

После одного из матчей участие в котором принимал Юрий Нырков к нему подошел Анатолий Тарасов и предложил перейти в ЦДКА. Нырков долго отказывался от перехода, однако, поступил приказ откомандировать его в команду, несмотря на болезнь его первым же самолетом отправили в Москву. 9 мая 1947 он приземлился в аэропорту Быково.

Сначало Нырков выступал за дублирующий состав ЦДКА, его команда заняла первое место, однако, Юрий в матче против киевского Динамо получил серьезную травму колена, которую залечивал в Феодосии.

В сезоне 1948 года Юрий стал игроком основного состава. Вместе с командой выиграл чемпионат и Кубок СССР, однако из-за простуды получил осложнение на почках, поэтому зимой 1949 лечился в госпитале имени Бурденко, а после по путевке Министерство Обороны Туркменском городке Байрам-Али.

Нырков выступал за ЦДКА до августа 1952, был вице-капитаном команды. Летом в составе олимпийской сборной СССР принял участие в XV олимпийский играх проходивших в Финляндии. После их окончания команда ЦДСА была расформирована, причиной этому послужило поражение от сборной Югославии на Олимпийских играх.

После расформирования ЦДСА выступал в команде г. Калинин, в последствии переименованной в МВО. После возрождения ЦДСА в 1954 снова начал играть в этой команде.

В 1958 году получил статус судьи республиканской категории.

Осенью 1953 года Юрий Нырков окончил футбольную карьеру и поступил в Академию бронетанковых войск, в 1956 году он окончил академию в звании майора, до 1964 года находился в различных командных должностях в Управлении кадров Группы Советских Войск в Германии.

Позже был переведен в Москву, где занял должность заместителя начальника управления кадров Академии Генерального Штаба, на которой проработал с 1965 по 1980 года. В 1980 году получил звание генерал-майора. До октября 1989 был начальником управления кадров Главного управления Генерального штаба СССР. Позже работал председателем Федерации футбола РСФСР и одновременно являлся заместителем председателя Федерации футбола СССР (1990-1991). После развала советского союза стал председателем комитета ветеранов РФС (1992-1997), в 1994—2005 - президент Фонда ветеранов армейского футбола имени Григория Федотова. Умер 20 декабря 2005 года, похоронен в Москве.